小五郎（東山紀之）は、こう（野際陽子）とふく（中越典子）から、病気を患う親戚の見舞いを押し付けられる。
小五郎を迎えた伊勢崎藤五郎（西村和彦）は、地位の高い寺社役付き同心であるにもかかわらず、病の妻・初枝（田中美里）の看病をしながら暮らす感じの良い侍だった。
だが、妻の薬代のせいで借金がかさんだ藤五郎は、小五郎にも借金を頼むほど金に困っているようで……
一方、不景気で金に困った涼次（松岡昌宏）は、お菊（和久井映見）の頼みで、病を治すと評判の陰陽師・百瀬清水（篠井英介）について探ることに。
彼の力は医者の隆玄（岩崎ひろし）も認めるほどだが、病人を身内に持つ者につけこんだ霊感商法だという噂もある。
そんな矢先、清水に騙されたという被害者・喜兵衛（樋浦勉）の訴えで、小五郎は伝七（福士誠治）とともに清水を取り調べに行くことになった。
だが、清水の祈祷所の門前に出てきたのは、あの藤五郎だった。
藤五郎は、陰陽師は町奉行の管轄外だと言い放つと、こないだとは打って変わった厳しい顔で２人を追い払った。
町奉行への訴えもままならず、喜兵衛は、清水に払うために借りた金の返済に困ることに。
しかも、その借金の証文を買い取ったのは、あの医者・隆玄であった。
隆玄の弟子・作治（篠塚勝）に娘を奪われ、喜兵衛は絶望の末に自殺してしまう。
一方、小五郎が初枝を訪ねると、彼女の暮らし向きは以前とくらべ良くなった様子で、首には清水の数珠が。
初枝は自分が余命を生きる身であることを明かすと、夫が良からぬことに手を染めているのでは、と心配する。
初枝の心配どおり、藤五郎は妻の命を永らえるための薬欲しさに、清水と隆玄と組んでいたのだった。
２人に頼まれ、藤五郎は清水を訴えようとしている商人を斬ろうとするが、見張っていた涼次に阻まれ、仕損じてしまう。
この事件が起こって、いよいよ町奉行所も本格的に清水の探索に乗り出した。
小五郎は藤五郎に手を引けと忠告するが、藤五郎は妻を生かすためなら仏も斬ると言い放った。
そして、隆玄の弟子・作治とともに、藤五郎は商人たちを斬り殺した。
そんな矢先、初枝の容態が悪化する。
初枝は息も絶え絶えに、生き地獄に落ちた夫を仕事にかけてほしいと小五郎に頼んだ。
仕事が始まり、涼次は隆玄を、源太（大倉忠義）は作治を、中村主水（藤田まこと）は清水を仕留めた。
小五郎は、夫と一緒に三途の川を渡るのが願いという初枝の言葉を噛み締め、藤五郎を斬った。
同じ頃、初枝も病床で息を引き取ったのだった。